20世纪90年代，医院为支持各业务科室的科研工作，主动负责解决科研成果鉴定评审费用和学术论文版面费。2000年，医院专门出台了《优秀论文评选及奖励办法》，2003年2月又出台了《关于鼓励科技进步、加强科研工作的奖励办法》，对科研工作的奖励事项作了详细规定使各业务科室及医护人员的科研工作积极性得到了充分调动和有效发挥，带动了医院科研工作的高效开展。1997年，医院被评为阜阳市卫生科技工作“十佳先进单位”。