核医学科成立于1991年，原名为放免室，是由北京市中国原子能科学研究院同位素研究所、安徽省蚌埠医学院核医学教研室技术协作和mg4355cc线路检测联合建立的医疗机构。核医学原属功能检查科管理，2002年划归检验科代管。

经过几年的快速发展，核医学科已成为医院重点特色科室之一和阜阳市唯一一家集检查、治疗于一体的正规科室，下设放免室、功能检查室和核素治疗室。科内现有FJ一2008P型自动Y计数器、核多功能检查仪(全市唯一)及大型高速离心机等一批现代化仪器，可以进行甲状腺、糖尿病、肿瘤标志物、肾功能、妇科等5个系列共10余个放射免疫项目的检查，这些项目均为全市唯一和领先项目。1998年以来，核医学科率先在全市开展了甲亢的Ⅲ碘一次性治疗项目，取得成功，治疗病人近千例，总有效率达98％。2003年，核医学科购买了代表免疫检测最高水平的电化学发光仪器一全自动电化学发光免疫分析仪(罗氏ELECSYS2010)，科内免疫检测水平跃至全省领先行列，一些新项目如性激素系列、新生儿优生优育系列及内风湿、甲亢型突眼及骨癌的“云克”高效治疗等也随之正在或即将陆续开展。核医学科多次应邀参加国家、省甲亢核素治疗会议，并与北京原子能科学研究所及蚌埠医学院保持长期技术合作关系。